Hm interessant. Heißt Ich müsste theoretisch die cygwin1.dll mit dazupacken?
Soweit ich weiß, ja. Und soweit ich weiß, gibt es auch keine Möglichkeit, das (z.B. mit static linking) zu umgehen.
Je nachdem, wie “langfristig” du was mit JNI machen willst, würde ich dir auch empfehlen, Visual Studio zu verwenden. Ich mag das auch nicht, und dass man sich registrieren muss, um es runterzuladen, ist eine Frechheit, aber … so ist das eben heute. Die Makefiles kann man dann mit CMake erstellen, und da kann man relativ einfach VS oder den GCC als Ziel einstellen. Das ist dann so “plattformunabhängig”, wie es eben sein kann…