So, hat sich jetzt erledigt.
Habe die .java-Files alle in eine extra Package geschmissen und mitkompiliert. (+ 20kb, aber das nimmt man gerne in Kauf).
Man kann auch mehr als ein JAR haben: man muss nur den ClassPath entsprechend anpassen. Z.B. im Haupt-JAR im Manifest “Class-Path: SwingWorker.jar” eintragen, und schon kennt die Haupt-JAR die zusätzliche Library.