Die Red-Hat-Entwickler aktualisierten unter anderem die CIFS-Unterstützung im Kernel, dessen Out-of-Memory-Killer sich nun deaktivieren lässt. Ähnlich wie bei RHEL 5.1 kamen einige neue Treiber hinzu oder wurden aktualisiert; neu ist etwa der Treiber pata_jmicron für die auf vielen modernen Mainboards mit Intel-Chipsatz zu findenden Jmircon ATA-Controller sowie der für Areca-Storage-Hardware geeignete Treiber arcmsr. Ferner wurden Samba, Gdm und Alsa aktualisiert und WPA Supplicant integriert. Als nicht von Red Hat im Rahmen des Support-Vertrags unterstützte Technology Previews liegen RHEL 4.6 unter anderem GCC 4.1 und OpenOffice 2.0 bei.